Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nae1Q8VBW6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms