Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r212Q8R268 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms