Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f4Q8R0K9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f4Q8R0K9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f4Q8R0K9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f4Q8R0K9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f4Q8R0K9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f4Q8R0K9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms