Protein–RNA interactions for Protein: Q8R054

Srpx2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpx2Q8R054 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpx2Q8R054 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Srpx2Q8R054 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms