Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OptnQ8K3K8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OptnQ8K3K8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms