Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdk5rap2Q8K389 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk5rap2Q8K389 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms