Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf39Q8K2Z2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf39Q8K2Z2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms