Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccm2Q8K2Y9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccm2Q8K2Y9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms