Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fbxo18Q8K2I9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fbxo18Q8K2I9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fbxo18Q8K2I9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fbxo18Q8K2I9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Fbxo18Q8K2I9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fbxo18Q8K2I9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms