Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1eQ8K202 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms