Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkd3Q8K1Y2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms