Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lmbrd1Q8K0B2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lmbrd1Q8K0B2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms