Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scamp1Q8K021 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms