Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne5Q8JZW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms