Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf628Q8CJ78 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf628Q8CJ78 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms