Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip10Q8CJ53 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms