Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LgsnQ8CIX8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LgsnQ8CIX8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms