Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab11fip3Q8CHD8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab11fip3Q8CHD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms