Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setd1bQ8CFT2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
Setd1bQ8CFT2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd1bQ8CFT2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd1bQ8CFT2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd1bQ8CFT2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setd1bQ8CFT2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms