Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms