Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp27Q8CEG8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp27Q8CEG8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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