Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh13Q8CEE7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rdh13Q8CEE7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh13Q8CEE7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh13Q8CEE7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rdh13Q8CEE7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh13Q8CEE7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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