Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc63Q8CDV6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms