Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc9Q8CDN9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms