Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc87Q8CDL9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc87Q8CDL9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms