Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nsun3Q8CCT7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Nsun3Q8CCT7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Nsun3Q8CCT7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Nsun3Q8CCT7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nsun3Q8CCT7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms