Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynpoQ8CC35 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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