Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn5Q8CBA2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms