Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nhsl1Q8CAF4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nhsl1Q8CAF4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms