Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf21bQ8C966 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf21bQ8C966 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms