Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Ccdc113Q8C5T8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc113Q8C5T8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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