Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssuh2Q8C3L1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms