Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac7Q8C2B3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdac7Q8C2B3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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