Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec22cQ8BXT9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec22cQ8BXT9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms