Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ube3dQ8BX13 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ube3dQ8BX13 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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