Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcl3Q8BVF2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pdcl3Q8BVF2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms