Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nup54Q8BTS4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nup54Q8BTS4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms