Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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