Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bnc2Q8BMQ3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms