Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem260Q8BMD6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms