Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan12Q8BKT6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms