Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tnrc6bQ8BKI2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnrc6bQ8BKI2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms