Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clrn3Q8BHH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clrn3Q8BHH8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Clrn3Q8BHH8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Clrn3Q8BHH8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clrn3Q8BHH8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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