Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Slc5a7Q8BGY9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Slc5a7Q8BGY9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc5a7Q8BGY9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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