Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg4dQ8BGV9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg4dQ8BGV9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms