Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cyp4f39Q8BGU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms