Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc25a40Q8BGP6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc25a40Q8BGP6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms