Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Htatsf1Q8BGC0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms