Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl42Q8BFQ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl42Q8BFQ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms