Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfascQ810U3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms